Qual a principal diferença entre os sistemas operacionais Windows e Linux?

O Windows possui código fechado, ou seja, o acesso ao seu código fonte não é liberado enquanto que no Linux o acesso ao código fonte é liberado.

Não existe diferença entre eles, só muda o fabricante.

No Windows é possível usar linhas de comando enquanto que no Linux o acesso é somente pela interface gráfica.

O Windows permite que se faça a instalação em várias máquinas sem necessidade de licença enquanto que o Linux é necessário comprar a licença.