Entre as principais bacias hidrográficas situadas no município de Fortaleza podemos citar:

Bacia do Rio Coreaú, Bacia do Rio Choró e Bacia do Rio Curú.

Bacia do Rio Cocó, Bacia do Rio Pacoti e Bacia do Rio Maranguapinho.

Bacia do Rio Jaguaribe, Bacia do Rio Acaraú e Bacia do Rio Salgado.

Bacia do Rio Cocó, Bacia do Rio Jaguaribe e Bacia do Rio Banabuiú.