Qual a finalidade da ocultação de arquivos e pastas no Windows?

Evitar que usuários façam alterações que danifiquem o S.O.

Diminuir a utilização de espaço do HD

Ficam invisíveis para que vírus de computador tenham dificuldade de localiza-los

Nenhuma, pois podemos torna-los visíveis facilmente no painel de controle

Por questão de organização, evitando o acúmulo em tela de arquivos que dificultam a tarefa de encontrar arquivos de interesse.