Depois que o novo sistema federal se estabilizou, sob o controle civil, no final da década de 1890, a intervenção do governo central nos estados tornou-se frequente, com exceção do

a exigência dos credores internacionais do Brasil de que novos empréstimos fossem concedidos desde que fossem afiançado pelo governo paulista.

a existência da Força Pública paulista, organização policial estadual, que era efetivamente um exército e chegou a contar com 14 mil soldados efetivos.

o direito que os paulistas tinham de controlar a taxa de câmbio da moeda nacional, condição que prejudicava as finanças federais.

a legislação tributária derivada da Constituição de 1891, que diminuía a autonomia dos estados, mas concentrava nestes a arrecadação dos impostos sobre a importação.

o controle exercido pelos paulistas sobre o Poder Judiciário federal, que sempre atendia aos interesses de São Paulo contra as demandas federais.