A partir de finais da década de 20 de Quinhentos, d. João III (1521-1557) decidiu iniciar a colonização do Brasil, tendo adotado, ao longo do período compreendido entre 1530 e 1548

foram retomadas todas as capitanias donatárias e o Conselho Ultramarino passou a indicar a figura de um vice-rei, que governava a partir de Salvador.

foi instalada uma nova ordem político-administrativa, sob o comando dos juízes da Câmara Municipal da capital Salvador, os chamados homens bons.

foi constituída por um sistema misto, que articulava um forte empenhamento militar, econômico e judicial da coroa com a manutenção das capitanias donatárias.

foi estabelecido um conselho administrativo, que contava com a participação dos capitães donatários e com representantes da burguesia mercantil portuguesa.

foi colocado em prática um formato administrativo tradicional da península Ibérica, no qual o comando da colônia estava nas mãos das capitanias reais.