Ao longo do eixo longitudinal de um rio, de acordo com o conceito de Contínuo Fluvial, pode-se identificar zonas, com características próprias, sendo a zona denominada de

médio curso, formada por rios com ordens superiores a 6. A respiração excede a produção primária, mesmo possuindo comunidades planctônicas desenvolvidas.

baixo curso, formada por cursos de água de ordens 1 a 3. A influência do aporte de material alóctone é significativo e, assim, essa região depende das contribuições terrestres de matéria orgânica.

nascente, apresenta sombreamento da mata ciliar inibindo a produção primária e, assim, a razão produção/respiração é inferior a um. Nela, a influência do aporte de material alóctone é significativo e, assim, essa região depende das contribuições terrestres de matéria orgânica.

baixo curso, constituída por cursos de água de ordens 4 a 6. Nesta zona, a água é mais turva e com maior carga de sedimentos finos, oriundos dos processos que ocorrem a montante.

médio curso, formada por cursos de água de ordens 1 a 3. Esta região caracteriza-se por ser um local de transferência de materiais e de sedimentação de partículas.