O princípio da descentralização pressupõe a concepção de direção única em cada esfera de governo. Isso significa que

o comando e as decisões devem observar a hierarquia entre as três esferas de governo.

as decisões devem ser tomadas de forma descendente, do nível central para o nível local.

cada esfera de governo é autônoma e soberana em suas decisões e atividades.

a direção nacional do SUS é responsável por organizar as ações em todos os níveis de assistência.

as esferas locais devem subordinar suas decisões às esferas centrais.