A alternativa em que a pontuação foi corretamente utilizada é:

A limpeza, não serve, somente para deixar um ambiente organizado e livre de sujeira, mas também para a eliminação, de bactérias e redução do risco de doenças que possam ser causadas por elas.

A limpeza não serve somente para deixar um ambiente organizado, e livre de sujeira, mas também para a eliminação de bactérias, e redução do risco de doenças, que possam ser causadas por elas.

A limpeza não serve somente para deixar um ambiente organizado e livre de sujeira, mas também para a eliminação de bactérias e redução do risco de doenças que possam ser causadas por elas.

A limpeza não serve somente para deixar um ambiente organizado e livre de sujeira, mas também para, a eliminação de bactérias e redução, do risco de doenças que possam, ser causadas, por elas.