A Hidrografia de Santa Catarina está dividida em três grandes bacias hidrográficas, a bacia do Rio Uruguai, do Rio Iguaçu e a bacia do Sudeste. Estas bacias podem ser subdividas em

As bacias hidrográficas de Santa Catarina são divididas em três vertentes: a do Atlântico, do Oeste e Norte. Elas não possuem ligação entre si e são divididas pela serra geral catarinense.

Os rios de Santa Catarina são divididos em duas vertentes: a do Atlântico e a do interior. Elas não têm ligação entre si e são divididas ao sul pela Serra Geral e ao norte pela Serra do Mar.

As bacias do Rio Uruguai e do Rio Iguaçu abrangem 63% do território catarinense, sendo que o Rio Uruguai é o maior rio catarinense e faz parte da divisa entre os Estados de Santa Catarina e Rio Grande do Sul.

A bacia hidrográfica do Sudeste possui 11 sub-bacias, entre elas os Rios Itajaí-Açu, o Rio Tubarão e Araranguá. A bacia do Sudeste banha o litoral catarinense, a região mais densamente povoada do Estado.