O município de Sena Madureira é atravessado por importantes rios que desempenham um papel fundamental na vida da população local, tanto para transporte quanto para abastecimento. E

Sena Madureira não possui rios navegáveis, pois sua geografia impede a existência de cursos d’água de grande porte.

O Rio Juruá corta o município e é responsável pelo abastecimento da maior parte da população local.

O Rio Iaco é um afluente do Rio Purus e sua vazão sofre influência direta das chuvas sazonais da Amazônia.

Os rios de Sena Madureira possuem fluxo constante e não sofrem alterações no nível da água ao longo do ano.