No trecho: "Imagino que, daqui a milhares de anos, quando a Terra for um deserto, exploradores de outras galáxias estudarão nossa história", o uso da forma "a" está correto, pois:

trata-se da fusão entre preposição e artigo definido, com valor locativo e indicativo de tempo futuro.

apresenta um erro ortográfico, pois deveria ser substituído por "há", já que o contexto se refere a uma ideia de tempo passado.

refere-se à preposição que introduz uma expressão de tempo futuro, seguindo as normas da língua portuguesa.

indica o artigo definido feminino singular que especifica o substantivo "milhares", relacionado ao tempo.