Durante a Crise do Império do Brasil, aconteceu uma crise conhecida historicamente como Questão Religiosa. Essa crise tinha como um dos principais motivos:

a ordem papal de proibir os católicos fazerem parte da maçonaria.

a insistência do Bispo de Belém, D. Antônio Macedo, de permitir que os católicos fossem maçons, obedecendo às ordens de D. Pedro.

a criação de uma nova ordem maçônica no Brasil com o apoio de D. Pedro.

a exigência dos líderes maçônicos para que o governo imperial adotasse políticas anticlericais e restringisse o poder da Igreja Católica.

a decisão de D. Pedro II de nomear maçons para cargos eclesiásticos importantes, desafiando a autoridade da Igreja Católica.