A dinâmica territorial de Jequié está profundamente vinculada a seus cursos d’água, que estruturam a ocupação urbana, condicionam práticas econômicas e configuram rotas históricas

O principal rio que atravessa e organiza o território de Jequié é o Rio de Contas, cuja importância para a navegação regional, para o abastecimento e para a fixação de atividades econômicas consolidou sua centralidade na formação e expansão do município.

O principal curso d’água do território jequieense é composto por afluentes da bacia do Paraguaçu, cuja predominância histórica e econômica determinou o traçado da malha urbana e orientou a construção das primeiras rotas comerciais do sertão baiano.

A hidrografia do município é marcada pela primazia do Rio São Francisco, cuja presença estruturou os caminhos de tropeiros e consolidou o núcleo urbano como entreposto vital de circulação entre o litoral e o interior sudoeste da Bahia.

O curso d’água mais significativo para o município é o Rio Parnaíba, elemento estruturante na conformação urbana e no desenvolvimento comercial que favoreceu o estabelecimento de rotas de integração do município com o norte do estado.